非洲Khoesan种群的遗传学映射到卡拉哈里沙漠地理

出版时间:周二,9月6日,2016 -十四36 在里面古生物学与考古学

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一个纳玛人在帐篷外拿着鞭子,在里士菲尔德放羊的时候,南非。
照片由Justin Myrick提供。
这是里奇特斯菲尔德社区保护区黄昏时的干旱山景,南非。
布伦纳亨恩
在卡拉哈里沙漠南部的≠Khomani San社区,人们坐着驴车旅行,南非。
照片由Brenna Henn提供。

地理和生态学是影响南部非洲人类群体遗传组成的关键因素,根据杂志上讨论的新研究遗传学,美国遗传学学会的出版物。通过调查22个霍桑族群的祖先,包括来自Nama和≠Khomani的新样本,研究人员得出结论,南部非洲种群的遗传聚类与喀拉哈里沙漠地区的生态地理密切相关。霍桑这个名字指的是南部非洲的几个土著居民;霍桑人说话“点击”语言包括狩猎采集者团体和牧民。它们在基因上是独特的,与所有其他非洲人口都有显著的隔离,表明他们是最早与人类祖先分化的群体之一。随着研究人员试图重建这种早期的分歧,许多科学兴趣都集中在霍桑身上;然而,直到过去十年,几乎没有收集到遗传物质。

Brenna Henn纽约石溪大学,研究南部非洲种群遗传学已有十多年。她指出,有一种趋势是把所有的南非土著人都归为一个群体——通常被称为“布须曼人”——但事实上,霍桑包括许多不同的种群。她和她的团队开始探索该地区的遗传多样性,并更好地了解这些Khoesan群体之间的差异。

“在过去的二十年左右,除了语言之外,人们对理解遗传模式是如何由地理因素决定的一直很感兴趣,”Henn说。人类群体之间的遗传差异与其语言史密切相关,这两个因素都与地理有关。亨恩认为,生态学和地理学相结合,可能比语言差异或生存方式(即狩猎/采集或耕作)。然而,关于南部非洲人口的大部分研究以前都集中在语言学和生存方面,很少关注生态地理学。

亨恩和她的同事分析了霍桑的遗传信息。他们收集了三个南非种群的全基因组数据:NAMA,这位≠Khomani San,以及南非有色(SAC)集团。他们的分析还包括19个南部非洲人口的样本。很快就发现卡拉哈里沙漠的地理位置与他们发现的人口结构密切相关。喀拉哈里沙漠的外缘阻碍了基因混合,而生活在喀拉哈里盆地的人口混合更自由。

他们的研究结果表明,霍桑种群的历史比最初预测的要复杂。以前的作品主张北方vs.人类群体的南向分化模式,但这项新的工作确定了该地区的五个主要祖先,它指出了一组地理上复杂的迁移事件,这些事件导致了该地区观测到的异质性。

亨恩指出,还有更多的霍桑人没有被抽样。由于许多原因,该地区的采样是一项重大挑战,包括后种族隔离时代该地区的复杂政治。南非和津巴布韦的大多数人口不再是霍桑人,在过去的500年里被吸收到其他人口中。仍然,他们的发现增加了有关南部非洲人口历史的知识体系,同时也使他们复杂化。

“有很多信息需要汇集在一起——语言学,生存,地理,遗传学,考古学他们不总是容易和解,”亨恩说。

这一挑战继续让亨恩和她的同事们着迷。她在2005年建立了一个实地调查点,并在多年来一直在维护和扩大它,因为她继续研究霍桑的祖先。她强调,在发展中国家开展研究的研究人员在努力了解该地区的遗传多样性时,与当地合作者密切合作是极其重要的。

“本文的第一作者,Caitlin Uren是南非学生。我为我们的合作和她出色的工作感到骄傲,”Henn说。

在了解和揭示促成南部非洲人口结构形成的因素方面还有许多工作要做。

“南部非洲人口有着巨大的多样性。这些群体说话方式不同,看起来与众不同,并有不同的遗传史。他们不是一模一样的人,导致分歧的历史和史前因素仍在探索中。令人惊讶的是,还有多少工作要做。”

来源:美国遗传学学会

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